Instituutin henkilöstöön kuuluvat johtaja Juha Mäkelä, tutkija Joanna Töyräänvuori, tutkija Jeanette Lindblom ja hallinnollinen avustaja Manal Chatila. Johtajan kausi kestää kolme vuotta ja tutkijoiden kaksi vuotta. Lisäksi henkilöstöön kuuluvat kahdesti vuodessa vaihtuva opetushallituksen EDUFI-harjoittelija ja residenssitutkija (resident scholar). Kairossa FIMEä edustaa tutkija Sylvia Akar.
