I institutets personal ingår direktör Juha Mäkelä, forskaren Joanna Töyräänvuori, forskaren Jeanette Lindblom och administrativ assistent Manal Chatila. Direktörens mandattid är tre år och forskarens två år. I personalen ingår dessutom Utbildningsstyrelsens EDUFI-praktikant – det finns två praktikanter årligen som har praktik på fem månader i följd – och en resident scholar. I Kairo representeras FIME av forskaren Sylvia Akar.
